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FreeBSD Ports: Biology

生物学に関連するソフトウェア。

InsightToolkit-2.8.1

Insight Toolkit
詳しい説明 | ソース | Main Web Site
保守担当者: bacon@smithers.neuro.mcw.edu
必要なもの: cmake-2.4.7
ここにも含まれています: Science

LBreeder-1.0_8

Allows you to display and breed L-system forms
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: dyeske@gmail.com
必要なもの: atk-1.18.0_1, bitstream-vera-1.10_4, cairo-1.4.10, compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, encodings-1.0.2,1, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, font-bh-ttf-1.0.0, font-misc-ethiopic-1.0.0, font-misc-meltho-1.0.0_1, font-util-1.0.1, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gettext-0.16.1_3, glib-2.12.13, gmake-3.81_2, gtk-2.10.14_3, hicolor-icon-theme-0.10_2, inputproto-1.4.2.1, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libGL-7.0.1, libGLU-7.0.1, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libdrm-2.3.0, libfontenc-1.0.4, libglut-7.0.1_1, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, libxml2-2.6.30, mkfontdir-1.0.3, mkfontscale-1.0.3, pango-1.16.5, perl-5.8.8, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, shared-mime-info-0.22, tiff-3.8.2_1, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, wxgtk2-2.4.2_15, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-fonts-truetype-7.3, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

adun-0.6_2

Molecular Simulator for GNUstep
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: gurkan@linuks.mine.nu
必要なもの: aspell-0.60.5_2, compositeproto-0.4, cups-base-1.3.3, damageproto-1.1.0_2, expat-2.0.0_1, ffcall-1.10_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gcc-4.2.2_20070927, gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, gnustep-back-0.11.0_1, gnustep-base-1.13.1_1, gnustep-gui-0.11.0_2, gnustep-make-2.0.1, gnutls-1.6.3, gsl-1.10, inputproto-1.4.2.1, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libaudiofile-0.2.6, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, libgcrypt-1.2.4_1, libgmp-4.2.2, libgpg-error-1.5, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libungif-4.1.4_5, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, libxml2-2.6.30, libxslt-1.1.22, mpfr-2.3.0, perl-5.8.8, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, portaudio-19.b1175, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, tiff-3.8.2_1, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4
ここにも含まれています: Gnustep

afni-2007.06.15.1339

Advanced Functional Neuro Imaging
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: bacon@smithers.neuro.mcw.edu
必要なもの: compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, endian-1.0, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, inputproto-1.4.2.1, jbigkit-1.6, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libGL-7.0.1, libGLU-7.0.1, libGLw-7.0.1, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libdrm-2.3.0, libfontenc-1.0.4, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, mpeg_encode-1.5b, netpbm-10.26.45, open-motif-2.2.3_5, perl-5.8.8, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, tiff-3.8.2_1, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, whirlgif-3.04, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4
ここにも含まれています: Science, Graphics

ariadne-1.3

Programs to compare protein sequences and profiles
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, libiconv-1.9.2_2

artemis-9

A DNA sequence viewer and annotation tool
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: diablo-jdk-1.5.0.07.01_7, inputproto-1.4.2.1, javavmwrapper-2.3, kbproto-1.0.3, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXau-1.0.3_2, libXdmcp-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXi-1.1.3,1, libXp-1.0.0,1, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, pkg-config-0.22, printproto-1.0.3, recordproto-1.13.2, xextproto-7.0.2, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4
ここにも含まれています: Java

avida-2.4.3

Avida is an auto-adaptive genetic system designed for ALife research
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: sf@slappy.org
必要なもの: cmake-2.4.7

babel-1.6_3

様々な分子ファイルのフォーマット間で変換をおこなうプログラム
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org
ここにも含まれています: Converters

belvu-2.29

A viewer for multiple sequence alignments
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: linux_base-fc-4_10

biococoa-1.6.0_1

Bioinformatics framework
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: dinoex@FreeBSD.org
必要なもの: aspell-0.60.5_2, compositeproto-0.4, cups-base-1.3.3, damageproto-1.1.0_2, expat-2.0.0_1, ffcall-1.10_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gcc-4.2.2_20070927, gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, gnustep-back-0.11.0_1, gnustep-base-1.13.1_1, gnustep-gui-0.11.0_2, gnustep-make-2.0.1, gnutls-1.6.3, inputproto-1.4.2.1, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libaudiofile-0.2.6, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, libgcrypt-1.2.4_1, libgmp-4.2.2, libgpg-error-1.5, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libungif-4.1.4_5, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, libxml2-2.6.30, libxslt-1.1.22, mpfr-2.3.0, perl-5.8.8, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, portaudio-19.b1175, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, tiff-3.8.2_1, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4
ここにも含まれています: Gnustep

biojava-1.5.b2_1,1

生物学のデータ処理のためのオープンソース java ツール
詳しい説明 | ソース | Main Web Site
保守担当者: nemoliu@FreeBSD.org
必要なもの: apache-ant-1.7.0_1, diablo-jdk-1.5.0.07.01_7, hsqldb-1.8.0.7_1, inputproto-1.4.2.1, jakarta-commons-cli-1.0_1,1, jakarta-commons-collections-3.2_1, jakarta-commons-dbcp-1.2.1_1, jakarta-commons-pool-1.3_1, jakarta-regexp-1.5_1, javavmwrapper-2.3, junit-3.8.2_1, kbproto-1.0.3, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXau-1.0.3_2, libXdmcp-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXi-1.1.3,1, libXp-1.0.0,1, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, pkg-config-0.22, printproto-1.0.3, recordproto-1.13.2, xerces-j-2.9.0_1, xextproto-7.0.2, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4
ここにも含まれています: Java

blat-33

A fast tool for local sequence similarity searches
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, libiconv-1.9.2_2

boinc-simap-5.10.5.09_1

Similarity Matrix of Proteins project for BOINC
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: pav@FreeBSD.org
必要なもの: ORBit2-2.14.9, atk-1.18.0_1, bitstream-vera-1.10_4, boinc-client-5.8.17, cairo-1.4.10, compositeproto-0.4, curl-7.16.3, damageproto-1.1.0_2, encodings-1.0.2,1, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, font-bh-ttf-1.0.0, font-misc-ethiopic-1.0.0, font-misc-meltho-1.0.0_1, font-util-1.0.1, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gconf2-2.18.0.1_1, gettext-0.16.1_3, glib-2.12.13, gnomehier-2.2_2, gstreamer-0.10.14, gstreamer-plugins-0.10.14,3, gtk-2.10.14_3, hicolor-icon-theme-0.10_2, inputproto-1.4.2.1, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libGL-7.0.1, libGLU-7.0.1, libICE-1.0.4,1, libIDL-0.8.9, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libdrm-2.3.0, libfontenc-1.0.4, libglut-7.0.1_1, libiconv-1.9.2_2, libmspack-0.0.20040308_3, liboil-0.3.12, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, libxml2-2.6.30, linc-1.0.3_6, mkfontdir-1.0.3, mkfontscale-1.0.3, pango-1.16.5, perl-5.8.8, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, popt-1.7_4, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, shared-mime-info-0.22, tiff-3.8.2_1, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, wxgtk2-2.8.5, wxgtk2-common-2.8.5, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-fonts-truetype-7.3, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

chemeq-1.50

化学反応の LaTeX のコードを出力する
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: bison-1.75_2,1, gettext-0.16.1_3, libiconv-1.9.2_2, m4-1.4.9,1
ここにも含まれています: Textproc

clustalw-1.83

多重配列整列プログラム CLUSTAL W
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org

crimap-2.4

Creation of multilocus linkage maps
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org

cycle-0.3.1_2

A calendar program for women
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: danfe@FreeBSD.org
必要なもの: atk-1.18.0_1, bitstream-vera-1.10_4, cairo-1.4.10, compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, encodings-1.0.2,1, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, font-bh-ttf-1.0.0, font-misc-ethiopic-1.0.0, font-misc-meltho-1.0.0_1, font-util-1.0.1, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gettext-0.16.1_3, glib-2.12.13, gtk-2.10.14_3, hicolor-icon-theme-0.10_2, inputproto-1.4.2.1, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libGL-7.0.1, libGLU-7.0.1, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libdrm-2.3.0, libfontenc-1.0.4, libglut-7.0.1_1, libiconv-1.9.2_2, libmspack-0.0.20040308_3, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, libxml2-2.6.30, mkfontdir-1.0.3, mkfontscale-1.0.3, pango-1.16.5, perl-5.8.8, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, printproto-1.0.3, py25-imaging-1.1.6_2, py25-numeric-24.2, py25-opengl-2.0.1.07_4, py25-tkinter-2.5.1_2, py25-wxPython-2.6.3.3_1, py25-wxPython-common-2.6.3.3_1, python25-2.5.1, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, shared-mime-info-0.22, tcl-8.4.16,1, tiff-3.8.2_1, tk-8.4.16,2, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, wxgtk2-2.6.3_4, wxgtk2-common-2.6.3_3, wxgtk2-contrib-2.6.3_2, wxgtk2-contrib-common-2.6.3_2, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-fonts-truetype-7.3, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4
ここにも含まれています: Deskutils, Python

distribfold-0.1.20040613

distributedfolding.org distributed protein folding project
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: compat4x-i386-5.3_9, localedata-5.4
ここにも含まれています: Net

dna-qc-1993.07.26

A quality control algorithm for DNA sequencing projects
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dotter-20021204

A viewer for multiple sequence alignments
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必要なもの: linux_base-fc-4_10

embassy-3.0.0_1

A collection of contributed EMBOSS applications
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保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, emboss-3.0.0_1, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gd-2.0.35,1, gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, inputproto-1.4.2.1, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, open-motif-2.2.3_5, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

emboss-3.0.0_1

遺伝配列解析のためのオープンソースツールコレクション
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保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: clustalw-1.83, compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gd-2.0.35,1, gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, inputproto-1.4.2.1, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libtool-1.5.24, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, open-motif-2.2.3_5, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, primer3-1.0.1, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

fasta-21.u1.d1

DNA, タンパク質データベース検索用のプログラム集
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org

fasta3-34.26.2

DNA, タンパク質データベース検索用のプログラム集, V 3
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fastdnaml-1.2.2_1

DNAML の高速版, 最尤法により系統樹を作成する
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保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, libiconv-1.9.2_2

finchtv-1.3.1

A chromatogram trace viewer
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必要なもの: linux_base-fc-4_10

fluctuate-1.40

A program to fit population models
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garlic-1.5_1

Molecular viewer, editor and visualization program
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保守担当者: maho@FreeBSD.org
必要なもの: compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, inputproto-1.4.2.1, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

genpak-0.26_4

GP は DNA 配列を扱うユーティリティ群です
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保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: freetype2-2.2.1_2, gd-2.0.35,1, gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, jpeg-6b_4, libiconv-1.9.2_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18

gff2ps-0.98d_1

Converts gff-formated genomic data-sets to PostScript
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保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: bash-3.2.25, gawk-3.1.5_1, gettext-0.16.1_3, libiconv-1.9.2_2

gmap-2006.04.21

A Genomic Mapping and Alignment Program for mRNA and EST Sequences
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保守担当者: rpz@cse.wustl.edu
必要なもの: gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, libiconv-1.9.2_2

gperiodic-2.0.10

元素の周期表を表示する
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必要なもの: atk-1.18.0_1, bitstream-vera-1.10_4, cairo-1.4.10, compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, encodings-1.0.2,1, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, font-bh-ttf-1.0.0, font-misc-ethiopic-1.0.0, font-misc-meltho-1.0.0_1, font-util-1.0.1, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gettext-0.16.1_3, glib-2.12.13, gtk-2.10.14_3, hicolor-icon-theme-0.10_2, inputproto-1.4.2.1, intltool-0.36.2, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, libxml2-2.6.30, mkfontdir-1.0.3, mkfontscale-1.0.3, p5-XML-Parser-2.34_2, pango-1.16.5, perl-5.8.8, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, shared-mime-info-0.22, tiff-3.8.2_1, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-fonts-truetype-7.3, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

grappa-2.0

Genome Rearrangements Analysis and Phylogeny Software
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, libiconv-1.9.2_2

hmmer-2.3.2

生物学的時系列解析のための隠れマルコフモデルを求める
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: perl-5.8.8

jalview-2.07_1

A viewer and editor for multiple sequence alignments
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: apache-ant-1.7.0_1, diablo-jdk-1.5.0.07.01_7, inputproto-1.4.2.1, javavmwrapper-2.3, kbproto-1.0.3, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXau-1.0.3_2, libXdmcp-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXi-1.1.3,1, libXp-1.0.0,1, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, pkg-config-0.22, printproto-1.0.3, recordproto-1.13.2, xextproto-7.0.2, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4
ここにも含まれています: Java

kinemage-5.79_1

特殊な関数を用いて分子を可視化するプログラム
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, inputproto-1.4.2.1, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, open-motif-2.2.3_5, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

lagan-1.2

Efficient tools for large-scale multiple alignments of genomic DNA
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: perl-5.8.8

lamarc-2.1,1

A package of programs for computing population parameters
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保守担当者: ports@FreeBSD.org

libgenome-0.5.2_1

Toolkit for developing bioinformatic related software in C++
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: libtool-1.5.24

linux-foldingathome-5.04

Distributed client for Protein Folding
詳しい説明 | ソース | Main Web Site
保守担当者: onatan@gmail.com
必要なもの: linux_base-fc-4_10

lsysexp-0.67_6

A GTK based program for viewing and creating L-system fractals
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: dyeske@gmail.com
必要なもの: atk-1.18.0_1, bitstream-vera-1.10_4, cairo-1.4.10, compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, encodings-1.0.2,1, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, font-bh-ttf-1.0.0, font-misc-ethiopic-1.0.0, font-misc-meltho-1.0.0_1, font-util-1.0.1, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gettext-0.16.1_3, glib-2.12.13, gtk-2.10.14_3, hicolor-icon-theme-0.10_2, inputproto-1.4.2.1, intltool-0.36.2, jpeg-6b_4, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, libxml2-2.6.30, mkfontdir-1.0.3, mkfontscale-1.0.3, p5-XML-Parser-2.34_2, pango-1.16.5, perl-5.8.8, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, png-1.2.18, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, shared-mime-info-0.22, tiff-3.8.2_1, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-fonts-truetype-7.3, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

mafft-5.743

Multiple sequence alignments based on fast Fourier transform
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: fasta3-34.26.2

migrate-2.3

A program to estimate population sizes and migration rates
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保守担当者: ports@FreeBSD.org

minc-1.4_2

Medical Imaging NetCDF
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: bacon@smithers.neuro.mcw.edu
必要なもの: libtool-1.5.24, netcdf-3.6.2
ここにも含まれています: Science

minc-2.0.09_1

Medical Imaging NetCDF
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: bacon@smithers.neuro.mcw.edu
必要なもの: hdf5-1.6.5, libtool-1.5.24, netcdf-3.6.2
ここにも含まれています: Science

molden-4.5_1

分子軌道と電子密度を 2D と 3D で表示する
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保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, gcc-4.2.2_20070927, inputproto-1.4.2.1, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libGL-7.0.1, libGLU-7.0.1, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libdrm-2.3.0, libfontenc-1.0.4, libglut-7.0.1_1, libgmp-4.2.2, libiconv-1.9.2_2, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, mpfr-2.3.0, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

mopac-7.1.10,1

半経験的分子軌道計算 (MNDO, etc.)
詳しい説明 | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: f2c-20060810_1, gettext-0.16.1_3, gmake-3.81_2, libiconv-1.9.2_2

nab-5.1.2

これは, 巨大分子の記述言語 nab (核酸ビルダー) です
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: mldodson@houston.rr.com
必要なもの: ucpp-1.3

ncbi-toolkit-2006.05.07_1

National Center for Biotechnology Information (NCBI) の開発キット
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: compositeproto-0.4, damageproto-1.1.0_2, expat-2.0.0_1, fixesproto-4.0, fontcacheproto-0.1.2, fontconfig-2.4.2_2,1, fontsproto-2.0.2, freetype2-2.2.1_2, inputproto-1.4.2.1, kbproto-1.0.3, libFS-1.0.0, libICE-1.0.4,1, libSM-1.0.3,1, libX11-1.1.3,1, libXScrnSaver-1.1.2, libXTrap-1.0.0, libXau-1.0.3_2, libXaw-1.0.4,1, libXcomposite-0.4.0,1, libXcursor-1.1.9, libXdamage-1.1.1, libXdmcp-1.0.2, libXevie-1.0.2, libXext-1.0.3,1, libXfixes-4.0.3, libXfont-1.3.1,1, libXfontcache-1.0.4, libXft-2.1.12, libXi-1.1.3,1, libXinerama-1.0.2,1, libXmu-1.0.3,1, libXp-1.0.0,1, libXpm-3.5.7, libXprintAppUtil-1.0.1, libXprintUtil-1.0.1, libXrandr-1.2.2, libXrender-0.9.4, libXres-1.0.3_2, libXt-1.0.5, libXtst-1.0.3, libXv-1.0.3,1, libXvMC-1.0.4, libXxf86dga-1.0.2, libXxf86misc-1.0.1, libXxf86vm-1.0.1, libdmx-1.0.2, libfontenc-1.0.4, liboldX-1.0.1, libxkbfile-1.0.4, libxkbui-1.0.2, open-motif-2.2.3_5, pixman-0.9.5_2, pkg-config-0.22, printproto-1.0.3, randrproto-1.2.1, recordproto-1.13.2, renderproto-0.9.3, scrnsaverproto-1.1.0, trapproto-3.4.3, videoproto-2.2.2, xbitmaps-1.0.1, xextproto-7.0.2, xf86dgaproto-2.0.3, xf86miscproto-0.9.2, xf86vidmodeproto-2.2.2, xineramaproto-1.1.2, xorg-libraries-7.3_1, xproto-7.0.10_1, xtrans-1.0.4

ortep3-1.0.3_3

Oak Ridge の結晶構造用の Thermal Ellipsoid プロットプログラム
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: ports@FreeBSD.org
必要なもの: gcc-4.2.2_20070927, libgmp-4.2.2, libiconv-1.9.2_2, mpfr-2.3.0

p5-AcePerl-1.91

ACEDB ゲノムデータベース用の perl インタフェイス
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: pgollucci@p6m7g8.com
必要なもの: p5-Cache-Cache-1.05, p5-Digest-1.15, p5-Digest-MD5-2.36, p5-Digest-SHA1-2.11, p5-Error-0.17.009, p5-IPC-ShareLite-0.09, p5-MIME-Base64-3.07, p5-PathTools-3.25, p5-Scalar-List-Utils-1.19,1, p5-Storable-2.16, perl-5.8.8
ここにも含まれています: Databases, Perl5

p5-Bio-ASN1-EntrezGene-1.091

Regular expression-based Perl Parser for NCBI Entrez Gene
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: mauricio@arareko.net
必要なもの: perl-5.8.8
ここにも含まれています: Perl5

p5-Bio-Das-1.06

Client-side library for Distributed Genome Annotation System
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: perl@FreeBSD.org
必要なもの: expat-2.0.0_1, freetype2-2.2.1_2, gd-2.0.35,1, jpeg-6b_4, libiconv-1.9.2_2, mysql-client-5.0.45_1, p5-AcePerl-1.91, p5-Authen-SASL-2.10_1, p5-Cache-Cache-1.05, p5-Class-ISA-0.33, p5-Compress-Raw-Zlib-2.006, p5-Compress-Zlib-2.006, p5-Convert-BinHex-1.119, p5-Crypt-SSLeay-0.57, p5-DBD-mysql-4.005, p5-DBI-1.59, p5-Digest-1.15, p5-Digest-HMAC-1.01, p5-Digest-MD5-2.36, p5-Digest-SHA1-2.11, p5-Email-Abstract-2.132, p5-Email-Date-1.10.2, p5-Email-Simple-2.00.3, p5-Error-0.17.009, p5-File-Temp-0.18, p5-GD-2.35_1, p5-GSSAPI-0.24, p5-HTML-Parser-3.56, p5-HTML-Tagset-3.10, p5-HTML-Tree-3.23, p5-IO-Compress-Base-2.006, p5-IO-Compress-Zlib-2.006, p5-IO-Socket-SSL-1.10, p5-IO-String-1.08, p5-IO-stringy-2.110, p5-IPC-ShareLite-0.09, p5-MIME-Base64-3.07, p5-MIME-Lite-3.02.0_1, p5-MIME-Tools-5.423,2, p5-MIME-Types-1.21, p5-Mail-Tools-1.74, p5-Module-Pluggable-3.6, p5-Net-1.22,1, p5-Net-SSLeay-1.30_1, p5-Parse-RecDescent-1.94, p5-PathTools-3.25, p5-SOAP-Lite-0.69, p5-Scalar-List-Utils-1.19,1, p5-Storable-2.16, p5-Test-Harness-2.64, p5-Test-Simple-0.72, p5-Text-Balanced-2.0.0_1, p5-Text-Iconv-1.5, p5-Text-Shellwords-1.08, p5-Tie-IxHash-1.21, p5-Time-Local-1.17, p5-Time-Piece-1.11, p5-TimeDate-1.16,1, p5-URI-1.35, p5-XML-DOM-1.44, p5-XML-Filter-BufferText-1.01, p5-XML-Handler-YAWriter-0.23, p5-XML-NamespaceSupport-1.09_1, p5-XML-Node-0.11, p5-XML-Parser-2.34_2, p5-XML-RegExp-0.03, p5-XML-SAX-0.16, p5-XML-SAX-Expat-0.39, p5-XML-SAX-Writer-0.50, p5-XML-Simple-2.18, p5-XML-Twig-3.29, p5-XML-Writer-0.603, p5-XML-XPath-1.13, p5-bioperl-1.4_1, p5-libwww-5.805, p5-libxml-0.08, p5-version-0.73, perl-5.8.8, pkg-config-0.22, png-1.2.18

p5-Bio-Phylo-0.16

Phylogenetic analysis using perl
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: aaron@FreeBSD.org
必要なもの: expat-2.0.0_1, freetype2-2.2.1_2, gd-2.0.35,1, jpeg-6b_4, libiconv-1.9.2_2, mysql-client-5.0.45_1, p5-AcePerl-1.91, p5-Archive-Tar-1.36, p5-Authen-SASL-2.10_1, p5-Cache-Cache-1.05, p5-Class-Data-Inheritable-0.06, p5-Class-ISA-0.33, p5-Compress-Raw-Zlib-2.006, p5-Compress-Zlib-2.006, p5-Convert-BinHex-1.119, p5-Crypt-SSLeay-0.57, p5-DBD-mysql-4.005, p5-DBI-1.59, p5-Devel-StackTrace-1.15, p5-Digest-1.15, p5-Digest-HMAC-1.01, p5-Digest-MD5-2.36, p5-Digest-SHA1-2.11, p5-Email-Abstract-2.132, p5-Email-Date-1.10.2, p5-Email-Simple-2.00.3, p5-Error-0.17.009, p5-Exception-Class-1.23_1, p5-ExtUtils-CBuilder-0.19, p5-ExtUtils-ParseXS-2.18, p5-File-Temp-0.18, p5-GD-2.35_1, p5-GSSAPI-0.24, p5-HTML-Parser-3.56, p5-HTML-Tagset-3.10, p5-HTML-Tree-3.23, p5-IO-Compress-Base-2.006, p5-IO-Compress-Zlib-2.006, p5-IO-Socket-SSL-1.10, p5-IO-String-1.08, p5-IO-Zlib-1.07, p5-IO-stringy-2.110, p5-IPC-ShareLite-0.09, p5-MIME-Base64-3.07, p5-MIME-Lite-3.02.0_1, p5-MIME-Tools-5.423,2, p5-MIME-Types-1.21, p5-Mail-Tools-1.74, p5-Math-Random-0.69, p5-Module-Build-0.28.08, p5-Module-Pluggable-3.6, p5-Net-1.22,1, p5-Net-SSLeay-1.30_1, p5-Parse-RecDescent-1.94, p5-PathTools-3.25, p5-SOAP-Lite-0.69, p5-SVG-2.33, p5-Scalar-List-Utils-1.19,1, p5-Spiffy-0.30, p5-Storable-2.16, p5-Test-Base-0.54, p5-Test-Harness-2.64, p5-Test-Simple-0.72, p5-Text-Balanced-2.0.0_1, p5-Text-Iconv-1.5, p5-Text-Shellwords-1.08, p5-Tie-IxHash-1.21, p5-Time-Local-1.17, p5-Time-Piece-1.11, p5-TimeDate-1.16,1, p5-URI-1.35, p5-XML-DOM-1.44, p5-XML-Filter-BufferText-1.01, p5-XML-Handler-YAWriter-0.23, p5-XML-NamespaceSupport-1.09_1, p5-XML-Node-0.11, p5-XML-Parser-2.34_2, p5-XML-RegExp-0.03, p5-XML-SAX-0.16, p5-XML-SAX-Expat-0.39, p5-XML-SAX-Writer-0.50, p5-XML-Simple-2.18, p5-XML-Twig-3.29, p5-XML-Writer-0.603, p5-XML-XPath-1.13, p5-YAML-0.65, p5-bioperl-1.4_1, p5-libwww-5.805, p5-libxml-0.08, p5-version-0.73, perl-5.8.8, pkg-config-0.22, png-1.2.18
ここにも含まれています: Perl5

p5-bioperl-1.4_1

生物情報学用の perl モジュールコレクション
詳しい説明 | パッケージ | ソース | Main Web Site
保守担当者: fernan@iib.unsam.edu.ar
必要なもの: expat-2.0.0_1, freetype2-2.2.1_2, gd-2.0.35,1, jpeg-6b_4, libiconv-1.9.2_2, mysql-client-5.0.45_1, p5-AcePerl-1.91, p5-Authen-SASL-2.10_1, p5-Cache-Cache-1.05, p5-Class-ISA-0.33, p5-Compress-Raw-Zlib-2.006, p5-Compress-Zlib-2.006, p5-Convert-BinHex-1.119,